温州地区行驶证补领办理机构是温州交通大队，依据《机动车登记规定》(令第124号)第四十四条，机动车号牌、行驶证灭失、丢失或者损毁的，机动车所有人应向登记地车辆管理所申请补领、换领。办理费用已降低，每本行驶证工本费从15元降为10元。法律分析；一、温州地区行驶证补领办理机构是温州交通大队。二、温州地区行驶证补领办理机构的规定依据是《机动车登记规定》(令第124号)第四十四条，该条规定机动车号牌、行驶证灭失、丢失或者损毁的，机动车所有人应向登记地车辆管理所申请补领、换领。三、温州行驶证补领办理的费用。