农产品的进项税抵扣方法包括从增值税专用发票、海关进口增值税专用缴款书以及农产品收购发票或销售发票中计算。一般纳税人购进农产品可通过抵扣增值税专用发票上的税额、海关进口增值税专用缴款书上的税额或按照农产品买价和13%扣除率计算的进项税额来抵扣销项税额。此外，还有特定行业可依据相关规定核定扣除方法。各地可根据实际情况自行扩大核定扣除范围。法律分析；农产品如何抵扣进项税。购进农产品，除取得增值税专用发票或者海关进口增值税专用缴款书外，按照农产品收购发票或者销售发票上注明的农产品买价和13%的扣除率计算的进项税额。计算公式为：进项税额=买价×扣除率买价，是指纳税人购进农产品在农产品收购发票或者销售发票上注明的价款和按照规定缴纳的烟叶税。