房产纠纷执行法院判的份额需要双方协商，协商不成时，法院强制执行。强制执行后，一方可单方申请房产登记。根据《不动产登记暂行条例》第14条，买卖、抵押等申请登记需双方共同申请，但特定情形下可由一方单方申请，如首次登记、继承、法院生效文书等。法律分析；房产纠纷执行法院判的份额需要双方先行协商，如果协商不成的，法院再根据实际情况强制执行。法院作出强制执行的判决后，一方当事人可以单方面进行申请房产登记。房产纠纷法院判的份额怎样执行的法律依据。《不动产登记暂行条例》第十四条。因买卖、设定抵押权等申请不动产登记的，应当由当事人双方共同申请。属于下列情形之一的，可以由当事人单方申请。（一）尚未登记的不动产首次申请登记的。（二）继承、接受遗赠取得不动产权利的。