医疗期应计入工作年限，保障劳动者合法权益。医疗期是劳动者依法享有的权益，根据《劳动法》及相关规定，患病或非因工负伤的劳动者有权享受医疗期。因此，在计算工作年限时，不应扣除劳动者的医疗期时间。医疗期与连续工作时间是同一概念，因此在计算医疗期和经济补偿时，也不应扣除劳动者此前享有的医疗期时间。这样做可以保障劳动者的合法权益。法律分析；医疗期算在工作年限里，应该享受合法权益。一、同一用人单位连续工作时间”是指劳动者与同一用人单位保持劳动关系的时间。二、按照《劳动法》及有关配套规章的规定，劳动者患病或非因工负伤，依法享有医疗期，因此在计算“同一用人单位连续工作时间”时，不应扣除劳动者依法享有的医疗期时间。