中国蕨类植物专家秦仁昌进一步将这些纲提升为亚门，形成了五个亚门的分类体系。蕨类植物属于高等植物中较种子植物低级的类别，历史上曾广泛存在，特别是在古生代的泥盆纪和石炭纪时期，甚至形成高大的乔木。然而，随着地质时期的推移，尤其是二叠纪到三叠纪之间，许多蕨类植物物种逐渐灭绝，其遗体则沉积地下，形成煤炭资源。现今，蕨类植物主要以草本形态存在，少数为木本。它们具有明显的根、茎、叶结构，并拥有维管束系统，但不具备花，而是通过孢子进行繁殖。孢子着地后会发育成原叶体，其上产生颈卵器，经过受精后，受精卵在颈卵器内发育为胚胎。这种世代交替现象在蕨类植物中尤为明显，无性世代占据优势地位。