通常，主动归还侵占的资金是减轻处罚的重要因素之一。受害公司可能会因此对行为人的行为表示谅解，从而在量刑时为行为人争取到更宽大的处理。但是，这种谅解需要通过正式的法律程序表达出来，公司必须提交书面的谅解书，且该谅解书需经司法机关审查确认。同时，行为人也需配合司法机关的调查，提供必要的证据和信息。值得注意的是，即使主动归还侵占的资金并取得公司谅解，也并不意味着可以完全避免法律责任。在司法程序中，法院会综合考虑各种因素，包括行为人的悔改表现、侵占金额的大小、对公司造成的损失程度等，来决定最终的处罚措施。因此，即使取得了公司的谅解，行为人仍需接受司法机关的调查和审判。