不可以直接与公司协商解决职务侵占的问题。一旦涉嫌职务侵占罪，案件将进入司法程序，这涉及法律的严肃性和权威性。在此情况下，公司没有权利单方面撤案。但是，如果能够在法律程序启动前，主动归还侵占的资金，并获得受害公司的谅解，可以从轻或减轻处罚。这要求行为人主动承认错误，并采取积极措施弥补损失，展现出真诚的悔改态度。
通常，主动归还侵占的资金是减轻处罚的重要因素之一。受害公司可能会因此对行为人的行为表示谅解，从而在量刑时为行为人争取到更宽大的处理。但是，这种谅解需要通过正式的法律程序表达出来，公司必须提交书面的谅解书，且该谅解书需经司法机关审查确认。同时，行为人也需配合司法机关的调查，提供必要的证据和信息。
值得注意的是，即使主动归还侵占的资金并取得公司谅解，也并不意味着可以完全避免法律责任。在司法程序中，法院会综合考虑各种因素，包括行为人的悔改表现、侵占金额的大小、对公司造成的损失程度等，来决定最终的处罚措施。因此，即使取得了公司的谅解，行为人仍需接受司法机关的调查和审判。
总的来说，面对职务侵占的问题，行为人应主动采取措施弥补损失，同时积极配合司法机关的工作，争取在法律允许的范围内获得从轻或减轻处罚的机会。这不仅有助于减轻个人的法律责任，也有利于维护公司的合法权益。
