当时，他是清华大学党支部书记、北平市西郊区党委委员。他起草了“一二·九”和“一二·一六”两个宣言以及北平市学联的一些重要文件，在当时的学生运动中发生过重要影响，为唤起全国爱国学生奋起抗日救亡作出了很大贡献。20世纪60年代初，蒋南翔还主持起草了“高教六十条”等学校规章，得到党中央的肯定，也受到各地高校的欢迎，起到了当时高等教育基本法规的作用。他提出要有计划按比例发展教育；充实加强小学、整顿提高初中、调整改革高中、大力发展职业教育；主持起草《中华人民共和国学位条例》等，为整顿恢复教育秩序、推进教育改革、加快教育事业的发展，作出了不可磨灭的贡献。