1、菌丝培养 接种后将瓶或袋移进培养室，温度控制在22～25℃，菌丝生长蔓延后，由于菌丝的呼吸作用会产生发酵热，比室温高3～4℃，所以室温比菌丝生长的适温可低3～4℃。2、一般接种后2～3天，菌丝就开始萌发，10天后就能向料内纵深蔓延生长，约经一个月左右，菌丝就能长满全瓶。由于金针菇栽培过程容易发生杂菌，在发菌阶段要认真检查，发现杂菌感染应及时处理或捡出，防止扩散蔓延。3、出菇后的管理 菌丝长满后，要立即进行搔菌（即将表面的老菌种刮掉），以促进原基和子实体形成。这时要加强通风和保持一定的散射光进行催蕾培养。4、子实体长出后，温度控制在8～14℃之间，空气相对湿度保持 90％～95％，并进行缓慢的通风换气。由于金针菇的主要食用部位是清脆的苗柄，以菌柄长而嫩的品质最高。