钟南山专长慢性阻塞性肺病及其他呼吸道病，2003年起中国历次呼吸道传染病（SARS、H1N1、H5N6、H7N9、MERS、COVID-19）的防治领军人。尤以在广东省防治2003年非典型肺炎（SARS）传染病闻名，他领导的广州呼吸疾病研究所主动接收SARS患者，并找出了医治皮质激素恶性股骨头坏死后遗症的疗法。2020年新型冠状病毒传染病暴发，83岁的钟南山“出山”任国家卫健委高级别专家组组长主理。