法律分析：一、在做工程中如果乙方违约该如何理赔呢。1、要求对方继续履行合同；要求对方支付违约金，不管是否发生了损害，只要有明确约定，违约方就应当支付违约金；要求对方赔偿损失。违约金具有担保债务履行的功效，又具有惩罚违约人和补偿无过错一方当事人所受损失的效果。2、法律依据。《中华人民共和国民法典》第五百七十七条当事人一方不履行合同义务或者履行合同义务不符合约定的，应当承担继续履行、采取补救措施或者赔偿损失等违约责任。二、已签协议甲方违约协议还有效吗。1、必须符合社会公共利益要求。合同中免责条款的订立，必须要保障公民及亲友的生命健康、名誉、荣誉、财产等免受损害，必须维护国家、集体或第三人的合法权益和利益，否则无效。