财政局发工资的流程是单位向银行提出申请并签订代发协议，将代发工资的明细和资金提供给银行，银行根据单位提供的信息为员工开立个人结算账户，并通过企业网上银行或银行工作人员上传工资文件完成代发。公司可以选择一家银行作为代发工资银行，并将代发数据交给银行，银行根据收到的数据将工资批量转入每张工资卡。如果公司基本账户不在代发银行，公司财务需要将资金划入代发银行的指定账户，然后银行再将工资批量转入每张工资卡。法律分析；财政局发工资的流程就是由单位制定工资表年度上交到财政局，然后财政局每月拨款。