纳税人已按预售面积、预售房款缴纳契税，但办理房产证时，发现实测面积与预售面积有误差，导致房款发生变化，致使纳税人多缴税款的，可以申请退税。依据的是税收征管法第五十一条：纳税人超过应纳税额缴纳的税款，税务机关发现后应当立即退还；纳税人自缴纳税款之日起三年内发现的，可以向税务机关要求退还多缴纳的税款。据相关的文件规定，个人购买住房时（“别墅”除外，下同），单套建筑面积在144平方米以下或者套内建筑面积120平方米以下的，并且该住房属于家庭（成员主要包括购房人、配偶和未成年子女，下同）少有住房的，契税减按1.5％征收。其中，对于购买单套建筑面积在90平方米及以下住房的个人，并且该住房属于家庭少有住房的，契税减按1％征收。法定税率为3％