醉驾免予刑事处罚和不起诉的区别在于对象、判定机关、判定时间和处理过程，醉驾免予刑事处罚是对已构成犯罪但情节轻微不需判刑者的法院判定，而不起诉是对不构成犯罪或证据不足者的检察院判定，前者适用于审理阶段，后者适用于起诉阶段。此外，醉驾不一定构成犯罪，也可能因追诉时效而不需处罚。法律分析；1、两者的性质不同；醉驾免予刑事处罚是针对的对象是已经构成犯罪，但犯罪情节轻微不需要判处刑罚的人；不起诉的对象则包括不构成犯罪、指控犯罪证据不足或存疑、犯罪情节轻微，依照刑法规定不需要判处刑罚或者免除刑罚的人。2、两者作出判定的机关不同。醉驾免予刑事处罚由法院作出判定，而不起诉决定则由检察院作出判定。3、两者作出判定的时间不同。免予刑事处罚适用于案件审理阶段，而不起诉适用于审查起诉阶段。4、两者的处理过程不同。