依据我国相关法律的规定，专利管理部门对专利代理机构的违法行为进行调查时，要及时、全面、客观、公正地调查收集与案件有关的证据。《专利代理管理办法》。第四十九条省、自治区、直辖市人民政府管理专利工作的部门应当及时、全面、客观、公正地调查收集与案件有关的证据。可以通过下列方式对案件事实进行调查核实。(一)要求当事人提交书面意见陈述。(二)询问当事人。(三)到当事人所在地进行现场调查，可以调阅有关业务案卷和档案材料。(四)其他必要、合理的方式。