医疗事故申请处理流程：申请人提交材料申请，争议处理机关审查并决定是否受理，不受理需说明理由，受理后移交医学会鉴定并通知申请人，医学会鉴定后市卫生局审核并作出结论，确定为医疗事故后双方可自愿调解。法律分析；1、准备申请书、相关证明材料等条例规定的材料申请。2、争议处理机关审查材料的管辖范围、申请人资格、时效、是否已进入调解或诉讼程序等内容，十日内决定是否受理。3、不论是否受理，争议处理机关都要已书面形式通知申请人，不受理的还要说明理由。4、机关自作出受理通知之日起五日内将材料移交医学会组织鉴定，并书面通知申请人。5、医学会作出鉴定，市卫生局审核后作出结论。6、确定为医疗事故的，医患双方共同申请并签署调解委托书，自愿调解。拓展延伸；医疗事故索赔流程和赔偿标准解析。