法律分析：保险公司拒绝承担染色体疾病的赔偿责任，是否合法需结合保险合同和相关法律法规具体分析。在保险合同中，应明确约定被保险人所患疾病的范围和赔偿标准。如果合同中未明确约定染色体疾病是否在保障范围内，则应参照相关法律法规。根据《保险法》规定，保险公司不得捏造虚假理由拒绝承担保险责任。同时，根据《合同法》的规定，保险合同应当按照公平原则订立，未约定的内容应当参照法律、法规或者当事人的交易习惯。因此，被保险人可以根据保险合同和相关法律法规的规定，要求保险公司承担染色体疾病的赔偿责任。法律依据。《保险法》第四十七条：“保险人应当按照保险合同的约定承担赔偿责任。保险人不得捏造虚假理由拒绝承担保险责任。”。