杭州区域指标过期了不会影响第二次申请。区域指标过期后可重新申请。增量指标过期后仍可申请区域指标。根据《杭州市小客车区域指标和浙A区域号牌设置管理办法》，审核通过状态的情况下，当场申请，立即出区域指标；其他情况的新申请，8号（含）之前申请的，23号出区域指标，8号之后申请的，次月23号出区域指标。区域指标申请流程如下：1、登录杭州市小客车总量管理信息系统（新用户需注册）。2、进入“用户中心”在“我的申请”中选择户籍类型，点击“区域指标申请”按钮，进入“个人申请”信息填报界面。3、填报完成，进入信息确认界面，点击“确认”进入“短信确认”界面。4、输入本人手机号完成短信确认，申请结束。