集体产权房屋是由区政府审批的集体土地上建造的房屋，不拥有土地使用证，不属于私产，不能上市交易。居住者只有农村集体房产权，没有完全独立产权。而小产权房则是指由乡镇政府颁发产权证的房产，一般是村集体组织或者开发商假设各种名义出售的。法律分析；主要区别如下：1、集体产权房屋一般建在集体土地上，不拥有土地使用证，不属于私产，不能上市交易，而是由区政府直接审批。居住者没有对房屋的完全独立产权，只有农村集体房产权。2、小产权房是人们在生活中形成的一种俗称。是指由乡镇政府颁发产权证的房产，一般是村集体组织或者开发商假设各种名义出售的。拓展延伸；集体土地与小产权房的本质差异。集体土地和小产权房是两种不同类型的房地产项目，它们的本质差异在于土地所有权和使用权。