农村垃圾主要是由城乡环境卫生行政主管部门来管的，并由乡镇人民政府进行处理。国务院环保部对全国环境保护工作实施监督管理；而县级以上地方人民政府的环保主管部门，对本行政区域内的环境保护工作实施监督管理。农村垃圾不清理投诉哪个部门。地市卫生局或卫生厅。一般情况是，诸层进行反映或投诉，进行解决，切忌越级反映。由于人们对工业高度发达的负面影响预料不够，预防不利，导致了全球性的三大危机：资源短缺、环境污染、生态破坏。垃圾污染由县级以上人民政府环境保护主管部门或者其他负有大气环境保护检督管理职责的部门责令改正，处二万元以上二十万元以下的罚款成违反治安管理行为的，由公安机关依法予以处罚。农村生活垃圾，归县级的环境保护主管部门管。