法律分析：公司罚款属于行政处罚的一种，依据《中华人民共和国行政处罚法》第四十条规定，行政处罚决定书送达后，当事人应当在规定的期限内履行义务。同时，《中华人民共和国行政诉讼法》第十七条规定，当事人不服行政处罚决定的，可以依法向人民提起行政诉讼。公司在罚款后，可以采取以下措施保持与部门的良好关系。1.全面改进管理，做好风险控制，避免再次触犯法律法规。2.主动与相关部门沟通，表现出积极的合作态度，尽快履行罚款义务。3.加强员工教育和培训，提高员工法律意识和风险意识，防范再次出现违规行为。4.对于罚款原因和情况，及时向相关部门进行说明，争取减轻罚款的数额。法律依据。《中华人民共和国行政处罚法》第四十条：行政处罚决定书送达后，当事人应当在规定的期限内履行义务。