公司能以体检不合格的理由辞退员工。员工已经入职，在公司的年度体检中检查不合格的，要按照国家医疗期的规定执行，医疗期满不能从事原工作，也不能从事另行安排工作的，才可以辞退，并且要依法支付经济补偿金。订立和变更劳动合同，应当遵循平等自愿、协商一致的原则，不得违反法律、行政法规的规定。劳动合同依法订立即具有法律约束力，当事人必须履行劳动合同规定的义务。劳动合同应当以书面形式订立，并具备以下条款。1、劳动合同期限。2、工作内容。3、劳动保护和劳动条件。4、劳动报酬。5、劳动纪律。6、劳动合同终止的条件。7、违反劳动合同的责任。哪些体检项目不合格会被公司辞退。