位于拱北—关闸口岸西南约800米处，是人员步行自助通行口岸，主要采用“合作查验、一次放行”自助通关模式，出入境各设置50条自助通道及2条人工通道，实施24小时通关。口岸联检楼2楼为出境大厅，3楼为入境大厅。青茂口岸主要为分流拱北—关闸口岸通关人流，符合条件使用“合作查验、一次放行”自助通关系统的内地及港澳居民可选择青茂口岸通关。青茂口岸；定位为人员步行自助通行口岸限内地及港澳居民持电子证件出入，7岁以下儿童一般是无法使用自助通道的，因为指纹或身高暂时达不到自动快速查验的要求，可以选择走人工通道，通关同时口岸也设立了学童通道，为往来珠澳两地的儿童提供服务。