不包括休息室，消毒供应中心分为工作区域和辅助区域，工作区域又分为去污区、检查包装灭菌区、无菌物品发放区三个区域，物品按照由“污”到“洁”，不交叉、不逆流的原则，空气流向由洁到污。去污区保持相对负压，检查包装灭菌区保持相对正压，无菌物品存放区保持微正压。三区均需设置实际的屏障及缓冲间，不允许逆行，各区之间的设备设施、人员相对独立。消毒供应中心的工作；并不只是简单的清洗，是技术活，也是体力活。小到手术台上的一把普通剪刀，大到目前世界较为先进的达芬奇机器人手术器械，凡是可以重复使用的医疗器械，都需要在消毒供应中心进行严格的清洗消毒灭菌处理。