1、鉴定人或鉴定机构因严重不负责任给当事人合法权益造成重大损失的。2、鉴定人或鉴定机构提供虚假证明文件或者采取其他欺诈手段，骗取登记的。3、鉴定人或鉴定机构经人民法院依法通知，拒绝出庭作证的。4、法律、行政法规规定的其他情形。如果司法鉴定机构违法违纪进行司法鉴定活动，则可以向省级司法行政部门投诉。司法行政部门可以对其违法行为进行调查和处理从而使得原鉴定结论作废或者司法鉴定结构主动撤销违法的鉴定结论。司法鉴定合法性原则，是指司法鉴定活动必须严格遵守国家法律、法规的规定。它是评断鉴定过程与结果是否合法和鉴定结论是否具备证据效力的前提。这一原则在立法和鉴定过程中主要体现为：鉴定主体合法；鉴定材料合法；鉴定程序合法；鉴定步骤、方法、标准合法；鉴定结果合法五个方面。一、鉴定程序违法该如何处罚。