除依法可以当场决定行政处罚的外，农业行政处罚机关对发现或举报事实比较复杂或情节比较严重的农业行政违法行为，决定依法实施行政处罚的，应按下列程序办理。（一）登记立案。受案人应当填写《行政处罚立案审批表》，报农业行政处罚机关主管领导批准立案。（二）调查取证。农业行政处罚机关必须对案件情况进行全面、客观、公正的调查收集证据；必要时，依照法律，法规的规定，可以进行检查。并依法制作《询问笔录》、《现场检查（勘验）笔录》、《抽样取证凭证》、《证据登记保存清单》等文书。