法律分析：员工发现公司内部存在职务犯罪行为，可以通过向公司举报来保护公司和自己的利益。根据我国法律规定，公司有义务对职务犯罪行为进行调查和处理；同时，对于举报人的保护也有相应的规定。法律依据。1.《刑法》第二百八十六条规定，职务犯罪的情形，依法追究刑事责任。2.《中华人民共和国公司法》第六十九条规定，公司有义务加强内部管理，保护举报人和证人的合法权益。3.《中华人民共和国劳动法》第八十规定，用人单位不得以任何方式降低职工的合法权益，不得打击报复职工举报侵害职工合法权益的行为。因此，员工举报公司职务犯罪行为是合法的行为，公司应该积极处理，对举报人进行保护，保障员工的权益。