分开三年不可以算自动离婚。我国的离婚方式只有诉讼离婚和协议离婚两种方式，没有自动离婚这种方式。分开三年如果真的想要离婚，双方可以达成离婚协议共同到婚姻登记机关进行离婚登记。双方达不成合意的，可以到人民起诉离婚。协议离婚的利弊分析；一、协议离婚的优势；1、操作简单快捷；只要双方协商好就可以去民政局办理离婚预登记，30天的冷静期过之后，就可以去民政局拿离婚证。2、不需要费用；诉讼离婚费用有：的诉讼费、起诉离婚律师费、房屋评估收费以及时间成本，其中起诉离婚律师费因地区差异而不同，没有统一的标准，应根据实际情况来定。而协议离婚这些费用都不需要。3、知道的人少，私密性强。