存疑不起诉并不代表无罪，存疑不起诉是指案件在阶段结束，而无罪判决是在阶段作出的，不起诉存在三种情况：法定不起诉、酌定不起诉和存疑不起诉，其中只有法定不起诉才表示无罪，其他情况下只是相对或暂时的无罪。法律分析；存疑不起诉不代表是无罪。一般来说，存疑不起诉，案件在阶段就结束了，而无罪判决是案件公诉到，作出的无罪判决，所处的阶段不一样，作出的机关不一样。而且不起诉并不一定意味着无罪，在刑法之相关规定里面不起诉存在三种情况。1、法定不起诉：存在于下列六种情况。（1）实施的行为情节显著轻微，危害不大，不认为是犯罪的。（2）犯罪已过追诉时效期限的。（3）经特赫令免除刑罚的。（4）依照刑法属于告诉才处理的犯罪，没有告诉或者撤回告诉的。（5）被告人死亡的。