实践中，存单质押的风险存在于质押是否有效设立，以及质押权的实现方式能否保障债权人(质权人)的利益。由于上述两种质押方式在质押的有效设立与质权实现的保障方面存在差异，故就两种不同方式的质押风险分别阐述。（一）银行贷款中的存单质押。对于以存单质押向银行贷款的情形而言，存单质押的风险主要表现为存单本身的瑕疵以及存单真实合法但银行未能办理登记止付手续而使质押流于虚空。这两种风险只在于银行一方。若存单本身系变造、伪造的假存单，而贷款银行并未核实及发现漏洞而予放款，那么当贷款到期时借款人可能无力偿还本息，此时因存单的瑕疵而致银行不能如愿实现质权，此即存单质押未能有效设立。或者存单本身系有效合法，但银行工作人员由于故意或工作失误而未将用于质押的存单进行登记止付处理，此时出质人仍可办理挂失并提走质押款项。