农村社保和灵活就业社保的区别如下：1、参保人群不同：农村社保主要针对本地户籍的城乡居民，而灵活就业社保则面向无雇工的个体工商户、非全日制和新就业形态从业人员等灵活就业人员。2、待遇水平不同：农村社保的养老金待遇主要由个人账户累计储存额决定，灵活就业社保的养老金待遇则包括基础养老金和个人账户养老金，根据缴费基数、缴费年限和社会平均工资进行测算。3、缴费基数和比例不同：灵活就业社保的缴费基数为上年全省在岗职工月平均工资的40%-100%，养老保险缴费比例为20%，医疗保险缴费以当地上年度城镇在岗职工月平均工资的80%为基数，按4.2%或8%比例缴纳基本医疗保险费。4、缴费主体不同：灵活就业社保由个人承担全额费用，而农村社保的费用可能由个人、政府补贴等多方共同承担。