船舶安全管理体系是指：能使公司人员有效执行公司安全和环境保护方针结构和相关文件体系。包括：安全管理手册、船舶安全手册、航海日志、法定的其他海事文件和证书、航行文件、甲板操纵、机仓操纵、应急程序、防污染措施、通讯程序、船舶与机器维护计划、安全设备表、船员训练计划等。为提高航运公司安全与防污染管理水平，保障水上交通安全，防止船舶污染水域环境，根据《中华人民共和国海上交通安全法》、《中华人民共和国内河交通安全管理条例》、《对确需保留的行政审批项目设定行政许可的决定》等法律、行规以及我国缔结或者加入的相关国际公约，航运公司应当建立、健全安全与防污染管理制度并文件化，完善安全与防污染条件，保障船舶安全，防止船舶污染水域环境。文件中明确任命适任的安全与防污染管理人员，并明确其岗位职责。