分居两年不影响婚姻关系存续期间。夫妻关系存续期间形成的财产属共同财产，离婚时需进行分割。分割原则包括遵从约定、平均分配、兼顾弱者和妇女权益，以及对方隐藏、转移、变卖财产的情况。对于婚前已按揭的房地产，婚后共同支付供楼款的部分应进行分割，按评估价计算共同财产权益，按揭人需支付对方50%的对价才能享有全部产权。法律分析；虽然分居两年，但仍然是婚姻关系存续期间。(一)夫妻关系存续期间所形成的财产和权益属夫妻共同财产，离婚时应对夫妻共同财产予以分割。(二)夫妻共同财产分割原则。1、遵从约定，包括婚前财产约定和婚后财产约定(比如AA制)。2、平均分配，即一般没有财产特别约定时，夫妻共同财产各占50%。3、兼顾弱者和妇女权益，弱者是指以下情形：如，离婚后生活有困难；一方身体患有疾病。