赠与合同和协议书在财产所有权转移和双方权利义务规定方面有区别。赠与合同中，赠与财产为不动产时，受赠人经过变更登记后取得所有权；赠与财产为动产时，受赠人经过交付后取得所有权。赠与财产的所有权可以进行占有、使用、收益和处分。协议书则是双方或数方为协作保障权益而签署的契约文书。法律分析；根据我国法律规定，赠与合同属于转移所有权的合同。与之相对的，协议书则是规定双方权利和义务的合同。当赠与财产为不动产时，进行变更登记之后，受赠人即取得了该财产的所有权。当赠与财产为动产的时候，交付之后，受赠人即取得了该财产的所有权。取得所有权之后，受赠人即可以对该财产进行占有、使用、收益和处分。对赠与财产本身的权利不能，只是可以附义务进行赠与，但这和赠与财产的权利是有区别的。二、协议书与合同区别。