律师分析。分居两年之后自动离婚是不合法的，我国法律规定，夫妻之间离婚只能通过协议离婚和诉讼离婚两种方式。夫妻双方分居满两年，感情确已破裂的，双方可以协议离婚，协议离婚不成的，可以向人民提起离婚诉讼。【法律依据】。《中华人民共和国民法典》。第一千零七十六条 夫妻双方自愿离婚的，应当签订书面离婚协议，并亲自到婚姻登记机关申请离婚登记。离婚协议应当载明双方自愿离婚的意思表示和对子女抚养、财产以及债务处理等事项协商一致的意见。第一千零七十九条 夫妻一方要求离婚的，可以由有关组织进行调解或者直接向人民提起离婚诉讼。人民审理离婚案件，应当进行调解；如果感情确已破裂，调解无效的，应当准予离婚。