专项附加扣除在申报的时候可以选择个人申报，也可以选择单位申报。1、一般个人申报的话是需要选择综合年度所得自行申报，往往需要等到次年的3月至6月期间再来对上一年度的专项附加扣除进行综合申报。2、个人申报是按年申报的；单位申报的话是直接选择通过扣缴义务人进行申报的，用户提交申请之后，单位会每个月直接按照个人提交的情况进行按月扣除的。个人所得税专项附加扣除包括。1、子女教育专项扣除，纳税人子女在学前或接受全日制学历教育费用时，可按每月1000元扣除。2、继续教育专项扣除，纳税人在中国境内接受继续教育，按每月400元扣除，同一学历扣除不得超过48个月。3、大病医疗专项扣除，在一年内，与医疗保险有关的医疗费用超过15000元的部分，汇算时扣除，限额为8万元。