入境超过5000美元处理方法如下：1、入境人员携带外币现钞入境，超过等值5000美元的应当向海关书面申报，如实申报的，海关会予以放行。如果未如实申报或未申报的话，会构成违规，将面临外币数额20%的罚款。2、当天多次往返及短期内多次往返者（指15天内出境或入境超过一次）不适用上述规定，且携带外币现钞入境不论金额大小都需向海关书面申报。3、出境携带外币现钞限额为每人等值5000美元，超过等值5000美元以上的，应向外汇指定银行或外汇管理部门申领《携带外汇出境许可证》（以下简称《携带证》），海关凭加盖外汇指定银行印章的《携带证》验放。4、出入境人员携带人民币现钞的限额为2万元。超过该限额的，一律不予放行。入境的申请流程如下：