医生入编和不入编的区别有。1、待遇不一样：在编的待遇主要表现为绩效工资，住房公积金，住房公积金补贴等，享受公务员待遇；不在编则不一定。2、晋升途径不同：在编可以考职称，也可以有升职的希望，不在编干升职的可能性要小一些。3、在单位的地位不同：有编制的有投票权，没有编制不一定有投票权。4、进入单位的方式不同：不在编的是合同工，是通过人事部门，或者用人事部门自行发布招聘信息，通过面试流程后，与用人部门签订劳动合同，建立的是劳动关系；在编则是通过公务员考试、事业单位考试和部队军官转业安置等方式获取编制而上岗工作。法律依据：《事业单位人事管理条例》第三十二条。