1、商标侵权店铺营业损失赔偿计算方法有3种。《商标法》第五十六条规定：“侵犯商标专用权的赔偿数额，为侵权人在侵权期间因侵权所获得的利益，或者被侵权人在被侵权期间因被侵权所受到的损失，包括被侵权人为制止侵权行为所支付的合理开支。前款所称侵权人因侵权所得利益，或者被侵权人因被侵权所受损失难以确定的，由人民法院根据侵权行为的情节判决给予五十万元以下的赔偿。”。2、商标侵权赔偿不起可以申请强制执行、或者也可以分期执行。可执行的前提是法院判决胜诉，且判决生效。法院会去查明对方名下的财产，如果是公司的话就是公司账户、实物出资等等；个人的话财产会广一些，包括房产、账户、股票、车辆等等。