房屋保险赔偿水灾损失，根据实际情况确定赔偿金额。自然灾害按实际损失赔偿，非自然灾害责任人或所有人承担部分或全部责任。保险合同规定下，保险公司必定赔偿，否则自行承担损失。法律分析；房屋保险会赔偿水灾所造成的部分损失，具体如下：1、如果是自然灾害或者极端恶劣天气情况下，赔偿数额按实际造成的损失确定。2、但若不属于自然灾害，那么造成损失的责任人或者所有人承担全部责任或者部分责任。只要符合保险合同的规定，保险公司是一定会赔偿的，如果不符合理赔要求，只能自己承担损失。拓展延伸；洪水灾害下的房屋保险责任与赔偿范围。