德国牧羊犬常见的皮肤病有真菌性皮肤病和寄生虫性皮肤病，这两种皮肤病都会导致狗狗皮肤受损，难受，需要及时治疗。真菌性皮肤病称为皮肤真菌病或称表面真菌病，是指真菌侵染表皮及其附属构造(毛、角、爪)的真菌疾病。皮肤真菌病的传播主要是通过动物的互相接触，或通过污染的物体而传播。在养犬数量较多且较密集的情况下，也可通过空气传播。夏季温暖、潮湿的气候为跳蚤、壁虱等昆虫提供了繁殖良机，这些寄生虫也会让德国牧羊犬感染皮肤过敏症。寄生虫引发的瘙痒通常发生在狗的背部和尾部，狗会用力抓挠、搓蹭、舌舔或撕咬撕咬瘙痒部位，从而使毛发脱落，皮质增厚并出现鳞斑等症状。虽然注射防过敏针剂可以缓解这类不适，但最根本的办法是消灭这些寄生虫，不仅要在犬的身上清除干净，而且要把狗的活动与休息场所进行彻底清除。