猫咪自发性膀胱炎的病因。目前认为FIC的病因可能与猫生活环境、紧迫压力有关，进而影响到神经系统及内分泌系统。交感神经系统的作用是释放內分泌激素，例如正肾上腺素和肾上腺素，而肾上腺(內分泌系统器官之一)则释放皮质醇和其他类固醇激素。辨别FIC是藉由一个过度兴奋的交感神经系统或是一个迟钝的內分泌反应，这个似乎不会影响健康的猫咪，任何计划去减少交感神经系统输出的治疗措施，对于减轻FIC的临床症狀都是很重要的。简单来讲，就是当外来的刺激被传递至脑部后会引起特定的生理反应。