结婚三个月起诉离婚，孩子如果是两周岁以下归女方，两周岁以上会根据有利于子女身心健康，保障子女的合法权益出发，结合父母双方的抚养能力和抚养条件等具体情况进行判决。根据《最高人民关于人民审理离婚案件处理子女抚养问题的若干具体意见》。人民审理离婚案件，对子女抚养问题，应当从有利于子女身心健康，保障子女的合法权益出发，结合父母双方的抚养能力和抚养条件等具体情况妥善解决。根据上述原则，结合审判实践，提出如下具体意见。第一条：两周岁以下的子女，一般随母方生活。母方有下列情形之一的，可随父方生活。（1）患有久治不愈的传染性疾病或其他严重疾病，子女不宜与其共同生活的。（2）有抚养条件不尽抚养义务，而父方要求子女随其生活的。