1、应以民事诉讼原告的起诉案由确定应当适用的鉴定程序和机构。2、应以《侵权责任法》实施后关于医疗损害赔偿的归责原则，结合民事诉讼程序法关于医患双方的举证责任分配规则，保障作为患方的原告享有充分的举证权利，以对应其所应承担的举证义务。3、对医疗损害案件审理中的鉴定问题有明确的规范，人民法院审理医疗损害纠纷类案件应当严格遵守，不应随意扩大理解。《最高法关于适用侵权责任法若干问题的通知》规定：人民法院适用侵权责任法审理民事纠纷案件，根据当事人的申请或者依职权决定进行医疗损害鉴定的，按照《全国人民代表大会常务委员会关于司法鉴定管理问题的决定》及国家有关部门的规定组织鉴定。在原告没有按照医疗事故赔偿纠纷(也无此案由)起诉的情况下，不能作为人民法院审理医疗民事损害纠纷案件的依据。