1、职位不同。科员一依照《中华人民共和国公务员法》对应的为一级科员；科员二依照《中华人民共和国公务员法》对应的为二级科员。2、定级不同。科员一的定级条件依照《新录用公务员任职定级规定》为二十六级至十八级；科员二的定级条件依照《新录用公务员任职定级规定》为二十七级至十九级。3、晋升要求不同。依照《公务员职务与职级并行规定》内容，晋升一级科员，应当任二级科员2年以上。公务员晋升职级资格。1、晋升一级巡视员，应当任厅局级副职或者二级巡视员4年以上。2、晋升二级巡视员，应当任一级调研员4年以上。3、晋升一级调研员，应当任县处级正职或者二级调研员3年以上。4、晋升二级调研员，应当任三级调研员2年以上。5、晋升三级调研员，应当任县处级副职或者四级调研员2年以上。