夫妻离婚时，有两个孩子的情况下，可以选择协议离婚或诉讼离婚。协议离婚需要双方协商达成一致意见，包括子女抚养等事项。诉讼离婚则由判决孩子的抚养权，未获得抚养权的一方有权看望孩子并支付抚养费。根据《中华人民共和国民法典》第一千零八十四条，不满两周岁的子女由母亲直接抚养，满两周岁的子女抚养问题由根据具体情况判决，尊重已满八周岁子女的真实意愿。法律分析；夫妻双方有两个孩子的，离婚时可以根据以下两种情况来选择不同的程序。1、协议离婚。夫妻双方进行协商，按照自愿原则达成对子女抚养等事项的一致意见。2、诉讼离婚。向人民提起诉讼，由判决孩子的抚养权。没有取得孩子抚养权的一方有权看望孩子，同时还应支付抚养费。《中华人民共和国民法典》第一千零八十四条。