一、被告不同意司法鉴定应该怎么办。可以要求进行重新鉴定。二、鉴定的流程；鉴定的受理；(一)初审----由鉴定人负责。——核对委托人(代理人)身份。决定受理的，应当复印委托人(代理人)的身份证明，或者收取委托人的介绍信，并作为司法鉴定业务档案卷宗材料序号1附属材料归档。——审核鉴定委托书；审核委托鉴定事项是否明确、用途和要求是否合法，是否属于本鉴定机构的鉴定范围，是否属于重新鉴定，委托人是否签字或盖章。【司法鉴定委托书】作为司法鉴定业务档案卷宗材料序号1归档。——审核鉴定材料；审核鉴定材料的种类、数量、性状、保存情况，鉴定材。料是否真实、完整、充分。【鉴定材料】作为司法鉴定业务。档案卷宗材料序号6归档。——商议委托鉴定事宜。