商铺合同发生纠纷时，可以尝试通过协商、调解、仲裁或诉讼来解决问题。根据《中华人民共和国民法典》第五百二十，当事人一方可以向起诉，若无法协商或调解失败，则可以依法行使不安抗辩权。在商铺转让时，需要注意签订正规转让协议、营业执照是否随店转让、店面是否面临拆迁等风险，以及转让费是否合理等事项。最好在转让协议签订过程中有中间人在场，以保障自己的权益。法律分析；如果商铺合同发生纠纷，可以尝试通过协商来解决问题。协商就是双方当事人自愿进行协商解决。（2）调解。调解就是通过第三方说服教育从而达到解决。（3）仲裁。仲裁就是由仲裁机构根据事实作出判断，在权利和义务上作出裁决。（4）诉讼。若无法协商的，当事人一方可以向起诉。2、法律依据：《中华人民共和国民法典》第五百二十【行使不安抗辩权】。