法律分析。新生儿医保和农保的区别也就是城镇居民医保和新农合的区别：1、是覆盖的人群不同。城镇居民医保主要覆盖城镇户籍的居民，新农合主要覆盖农村户籍居民。2、是管理的部门不同。城镇居民医保主要由门管理，新农合多数地方由卫生部门管理。3、是保障待遇的侧重点不同。城镇居民医保主要保住院和门诊大病兼顾普通门诊，所以住院及门诊大病待遇都要高于新农合。新农合的门诊待遇水平要高于城镇居民医保。法律依据。《中华人民共和国社会保险法》。第二条 国家建立基本养老保险、基本医疗保险、工伤保险、失业保险、生育保险等社会保险制度，保障公民在年老、疾病、工伤、失业、生育等情况下依法从国家和社会获得物质帮助的权利。第二十六条 职工基本医疗保险、新型农村合作医疗和城镇居民基本医疗保险的待遇标准按照国家规定执行。