合作协议书的注意事项包括：理清合伙人的职责、议事规则、出资份额、分红和退出机制；审查合伙人的主体资格；命名合伙企业时避免使用“有限”或“有限责任”字样；明确约定合伙人的权利和义务。法律分析；合作协议书注意事项主要有。1、理清合伙人的职责、议事规则、出资份额、如何分红以及退出机制。2、审查合伙人的主体资格。3、命名合伙企业时，不得包含“有限”或者“有限责任”字样。4、明确约定合伙人各自的权利与义务。拓展延伸；合同签署前的重要事项和注意事项。